Sbírky cukrovarnické jsou nejstaršími sbírkami muzea. Základem kolekce byly exponáty z výstavy Živnostensko-obchodní komory konané v Praze v roce 1908, které byly postupně rozšiřovány. Nejvýznamnějším exponátem je model cukrovaru z roku 1908 v měřítku 1:10 s inventárním číslem 1, představující typický český cukrovar té doby o kapacitě 500 tun řepy denně. Model je rozpracován do nejmenších detailů a jeho rozměry jsou 8,7 m (šířka), 4,7 m (hloubka) a 3,5 m (výška). Vzorky surovin, meziproduktů a výrobků pocházejí z období ohraničeného lety 1870 až 1890. Z laboratorních přístrojů a zařízení je součástí fondu unikátní sbírka cukrovarnických polarimetrů (asi 20 kusů), v níž nejstarší pochází z doby kolem roku 1860, kolekce laboratorního skla, různé hustoměry, váhy, pyknometry a průtoková měřidla.
Současné sbírky byly systematicky organizovány od počátku existence muzea. Dnes čítají kolem 30 inventárních čísel, protože značná část původního fondu byla předána Pivovarskému muzeu v Plzni. Sbírky zahrnují různá strojní zařízení a jejich součásti včetně laboratorního vybavení. Mezi význačné exponáty patří model parostrojního pivovaru z let 1910 až 1920, část desky z kvasné kádě z roku 1780, staré bednářské nástroje (1890–1910), myčka na láhve (1880), plnička lahví (1880), zkušební várnička sládka Josefa Kořána (1860), mosazné hustoměry (1850–1860) a pečetní prsten s pivovarským znakem (1890).
Současné sbírky lihovarnictví zahrnují přibližně 50 inventárních čísel. Převažují různá strojní zařízení a jejich modely a laboratorní vybavení. Významnými exponáty jsou modely lihovarů z roku 1890, 1908 a 1920, model pařáku na brambory a obilí z roku 1890 a destilační aparát z roku 1920. Ve sbírce je dále asi 15 kontrolních lihových měřidel od různých výrobců z let 1890 až 1930 a 10 kontrolních hustoměrů z let 1870 až 1930.
Sbírky mlynářství patří k nejstarším sbírkám muzea. V současné době obsahují kolem 40 inventárních čísel. Jsou zde modely různých typů mlýnů a jejich zařízení, součásti mlýnských zařízení, řemeslnických nástrojů, vzorky surovin, meziproduktů a hotových výrobků. Diagramy a schemata technologických postupů mletí. Významnými exponáty jsou model parostrojního mlýna z r.1908, model větrného mlýna (1860), model mlýna na svrchní vodu (1860), model šrotovníku (1910), kolekce mlynářského nářadí (1890), domácí mlýnec na šrotování obilí (poč. 19. stol.) a mlecí kameny různých typů (1890–1920).
Zahrnuje sbírky potravinářského průmyslu z oborů mlékárenství, pekárenství, výroby margarinu, výroby čokolády a cukrovinek. Celkem je zde evidováno asi 40 inventárních čísel. Význačnými exponáty jsou odstředivky na mléko Pfanhauser (1885) a Škoda (1930), dřevěný model živnostenské pekárny z let 1880 až 1900, model výrobny margarinu 1928–1930, model továrny na čokoládu 1920–1925, modely strojů a zařízení z továrny na čokoládu (1910) a vzorky kávovin a obalů (1920–1930).